第二代杂交水稻品种出现在1980年代,其恢复系是IR30的衍生系,IR30也是国际水稻研究所培育出的品种,它的衍生系作恢复系培育出的典型代表性杂交水稻品种包括威优64、汕优64、博优64、汕优63、D优63等。
第二代杂交水稻是以光温敏核不育系为遗传工具的两系法杂交稻,1995年研究成功,目前年推广面积约8000万亩左右,其中两优培九、Y两优1号、深两优5814等品种推广面积最大。两系法不受恢保关系制约,配组自由,资源利用率高,易于选育优良组合,但育性受气温高低决定,若遇异常天气易出现制种和繁殖失败。
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