1、嘧啶
2、嘌呤
3、碱基的性质
碱基的互变异构:
核糖和脱氧核糖:
D-核糖 存在于RNA
2-脱氧-D-核糖 存在于DNA
差别:- 2'-OH vs 2'-H
这种差别影响到二级结构和稳定性。
二、核苷
1、核苷
核苷是由戊糖和碱基通过β-N糖苷键形成的糖苷。核苷中的戊糖有D-核糖和2-脱氧-D-核糖两种,它们都以呋喃型环状结构存在。前者形成核糖核苷,后者形成脱氧核苷。核苷中的糖苷键由戊糖的异头体C原子与嘧啶碱基的N1或嘌呤碱基N9形成。为了避免碱基环上原子的编号与呋喃糖环上原子编号混淆,在呋喃环上各原子编号的阿拉伯数字后需加“′”.
在核苷中,碱基在糖苷键上的旋转受到空间位阻的限制。结果核苷和核苷酸能以顺式和反式两种构象存在。顺式核苷的碱基与戊糖环在同一个方向,反式核苷的碱基与戊糖环在相反的方向。
由于嘧啶环O2和戊糖环C5′之间的空间位阻,嘧啶核苷通常为反式构象。嘌呤核苷可采取两种构象。自由的嘌呤核苷(特别是鸟苷)更容易形成顺式构象,但是,DNA和RNA螺旋中的嘌呤核苷主要为反式构象。
2、密啶核苷和嘌呤核苷的化学结构
3、几种修饰核苷
三、核苷酸
1、核苷酸
核苷酸是核苷的戊糖羟基的磷酸酯。核糖核苷的磷酸酯为核糖核苷酸,脱氧核苷的磷酸酯为脱氧核苷酸。理论上,核苷的5′-OH、3′-OH和2′-OH均可以被磷酸化而分别形成核苷-5′-磷酸、核苷-3′-磷酸和核苷-2′-磷酸。但是,自然界的核苷酸多为核苷-5′-磷酸。
核苷单磷酸(NMP)是指核苷的单磷酸酯。核苷单磷酸可以通过一次成酐反应形成核苷二磷酸(NDP)。核苷二磷酸再通过一次成酐反应生成核苷三磷酸(NTP)。为了将核苷二磷酸和核苷三磷酸上不同的磷酸根区分开来,将直接与戊糖5′-羟基相连的磷酸定为α磷酸根,其余两个磷酸根从里到外依次被称为β磷酸根和γ磷酸根。
2、常见的核糖核苷酸的化学结构
3、AMP、ADP和ATP
4、核苷酸的生物功能
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