PCR循环参数对于PCR反应的成功至关重要。首先,预变性,或称模板DNA的完全变性和PCR酶的激活,通常建议按照试剂说明书中的指导进行,通常Taq酶的激活时间建议为两分钟,以确保充分激活。
在变性步骤中,一般将温度设定在95℃,持续30秒,这样可以充分变性各种靶DNA序列。但是,变性时间过长可能导致酶活性受损,而时间过短则可能导致靶序列未完全变性,增加扩增失败的风险。因此,需要适当调整以达到最佳效果。
引物退火是PCR的重要环节,通常根据引物的Tm值进行设定,对于扩增长度,可能需要适当降低退火温度。在实验中,需要根据实际情况进行预估,以确保退火温度对PCR特异性的影响最小化。
接着是引物延伸,一般在72℃进行,这是Taq酶的最适温度。但对于短片段扩增且退火温度较高的情况,此步骤可能可以省略,但延伸时间会根据扩增片段的长度而变化,对于1000bp以上的片段,推荐每kb大约1分钟,而含Pfu及其衍生物的反应可能需要更长的时间。
PCR循环的次数通常在25-40次之间,过多的循环可能导致非特异性的扩增,因此需要恰到好处。最后的延伸步骤在最后一个循环后进行,通常在72℃维持5-15分钟,以确保引物完全延伸并使单链产物退火成双链。
然而,PCR过程中必须注意污染问题,特别是样品间的交叉污染和先前PCR产物的残留(carry-over),这些都可能引入假阳性结果,因此实验操作时必须严格遵循无菌操作规程,以保证结果的准确性。
扩展资料
聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction),简称PCR,是一种分子生物学技术,用于放大特定的DNA片段。可看作生物体外的特殊DNA复制。
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