这两所大学属于同一个层次的学校，最好根据所选专业的强弱选择学校，适合自己的才是最好的！

不存在说哪一所一定就更好，哪一所就一定更差；

如果从综合实力和人才培养层次看，安徽工程大学要好一点，1978年开始本科招生，目前有硕士点49个（合肥学院暂无独立授权的硕士点），B类省重点学科6个（合肥学院有一个C类省重点学科，C类的水平和层次比B类差逊色些）；安徽工程大学全国综合排名371，合肥学院全国综合排名523

大学好坏最主要不在于位置，而是师资、培养质量、毕业生的发展和就业情况！

“大学者，非谓有大楼之谓也，有大师之谓也”！ ---- 这句话很好定义了优秀大学的核心价值

建议楼主去看看两所学校本科招生分数线（安徽工程学院的录取分数比合肥学院高 8 - 10分）、师资方面差距还是有的；不过各有千秋，合肥学院的位置确实更优越，某些学科的培养还是挺不错的，是教育部首批授权“卓越工程师教育培养计划”的61所高校之一，位于省会合肥，在就业等各方面有近水楼台的便利；

合肥学院成立于1980年，截止2011年，学校有1个安徽省级重点学科（微生物学）；1个安徽省重点试验培养专业（金融学），5个国家级特色专业建设点（生物工程，电子信息工程，物流管理，计算机科学与技术，化学工程与工艺）；5个省级特色专业建设点 （电子信息工程、物流管理、机械设计制造及其自动化、国际经济与贸易、工程管理）；4个卓越工程师教育培养计划实施专业（工业设计、机械设计制造与自动化、软件工程、化学工程与工艺）。

安徽工程大学

国家级特色专业：

机械设计制造及自动化

自动化

艺术设计

省级特色专业：

纺织工程

行政管理

省级重点学科：

管理科学与工程 B类

设计艺术学 B类

机械制造及其自动化 B类

检测技术与自动化装置 B类

纺织工程 B类

发酵工程 B类

合肥学院：

国家级特色专业：

生物工程（就业很难，去向差）

电子信息工程

物流管理

计算机科学与技术

化学工程与工艺

合肥学院省级重点学科：

微生物学（培育） C类 -- 档次和实力低于B类，属于预备级省重点学科

希望我的回答您能满意！

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文章来源：天狐定制

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