国家海洋局设有三个综合性海洋研究所,分别是位于山东青岛的海洋一所,浙江杭州的海洋二所,以及福建厦门的海洋三所。这三所机构负责全面深入的研究工作,推动海洋科学的发展。
除此之外,还设有多个非综合性海洋研究机构。天津海洋技术所与海洋信息中心专注于技术与信息的研究;杭州海水淡化所致力于水处理技术的研究;北京战略所与卫星应用中心关注海洋战略与卫星应用;大连监测中心则负责海洋环境的监测与评估。此外,青岛北海分局、上海东海分局与广州南海分局也设有研究机构,开展各类海洋研究工作,包括多个研究室。
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