医院在药学专业职称的认可上，主要承认的是药师、主管药师、副主任药师和主任药师等职称，这些职称是通过国家卫生部组织的全国卫生专业技术资格考试获得的。而执业药师是由国家食品药品监督管理局和人力资源和社会保障部门共同组织的全国执业药师资格考试所授予的资格，其主要的执业范围是在药品生产、流通和使用环节。

尽管执业药师资格在全国范围内得到认可，但在医院系统中，由于历史和体制上的原因，执业药师并未被广泛承认。这是因为医院药剂部门的工作，主要是为医院临床药学服务，而执业药师所涉及的药品生产、流通和使用环节与医院药剂部门的职能有所区别。因此，医院在职称认定上，更倾向于认可卫生系统所评定的药师职称。

然而，值得注意的是，随着医药体制的改革和药学服务的不断发展，一些省份已经开始探索将执业药师纳入医疗机构药学专业技术人员管理的方法，允许执业药师在一定条件下担任主管药师职务。这表明，执业药师的职业地位和作用正在逐步得到认可和重视。

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