纳税人丢失发票，大多是由保管不善造成。未经过税务机关审核同意，发票取得方用开具方提供的复印件、证明等资料不能作为税前扣除凭据。处罚方式与发票类型相关，具体如下。

一、丢失空白发票的处理

1，纳税人丢失空白专用发票，应根据《发票管理办法实施细则》第三十一条规定：“使用发票的单位和个人应当妥善保管发票。发生发票丢失情形时，应当于发现丢失当日书面报告税务机关，并登报声明作废”。

因此，纳税人丢失专用发票后，必须按规定程序向当地主管税务机关报告。纳税人应将丢失专用发票的纳税人名称、发票份数、字轨号码等情况，向主管税务机关指定的报刊等媒介刊登公告声明作废，然后填报《发票丢失被盗登记表》，持IC卡到国税主管机关办理电子发票退回或作废手续。

税务机关对丢失专用发票的纳税人，可以按《发票管理办法》第三十六条“违反发票管理法规的行为包括：

（五）未按照规定保管发票的”情形，由税务机关责令限期改正，可以并处1万元以下的罚款。

2，纳税人丢失空白普通发票后，必须按规定程序向当地主管税务机关报告，丢失普通发票的纳税人必须自行到辖区内的地级市报刊上刊登“丢失声明”，然后填报《发票丢失被盗登记表》，持IC卡到国税主管机关办理电子发票退回或作废手续。

税务机关对丢失空白普通发票的纳税人，可以按《发票管理办法》第三十六条“违反发票管理法规的行为包括：

（五）未按照规定保管发票的”情形，由税务机关责令限期改正，可以并处1万元以下的罚款。

二、纳税人丢失已开具的增值税专用发票的处理

纳税人将已经填开的增值税专用发票丢失，应主要依据《国家税务总局关于修订〈增值税专用发票使用规定〉的通知》（国税发[2006]156号）第二十八条和第二十九条的规定处理。

纳税人丢失增值税专用发票各联次，具体处理分为已认证和未认证两种情形。

希望以上内容能对您有所帮助，如果您还有其它问题请咨询专业律师。

【法律依据】：《中华人民共和国税收征收管理法》第二十一条税务机关是发票的主管机关，负责发票印制、领购、开具、取得、保管、缴销的管理和监督。单位、个人在购销商品、提供或者接受经营服务以及从事其他经营活动中，应当按照规定开具、使用、取得发票。发票的管理办法由国务院规定。

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文章来源：天狐定制

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