气孔与叶的功能密切相关，气孔既是叶与外界进行气体交换的门户，又是水分蒸腾的通道。叶下表皮避开日光直射，温度较上表皮低，因而气孔多位于下表皮，以利于减少水分的蒸腾。其次当光线很强时，叶上表皮气孔关闭，叶下表皮气孔仍然开张，以进行气体交换，促进光合作用，使植物能更充分利用光能，所以气孔多分布于叶下表皮。
对于沉水植物来说：
由于气孔的功能是控制气体交换和水分蒸腾，沉水植物在水中无法进行蒸腾作用，溶于水中的气体也较少，所以一般来说，气孔对于沉水植物的叶无生物学意义。
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