方法论自然主义论证基于两个前提：(1)一个人的形而上学承诺，应该接受自然科学方法的指引；(2)自然科学理论所确立的世界图像，就应该是我们的形而上学。这个论证的结论是：世界只包括自然科学所推设的物项。比如，阿姆斯壮(David Armstrong)就明确声称，“世界只包含物理学所承认的物项”。[5]

这个论证真的像物理主义者所认为的那样具有很强的说服力吗？该论证的第一个前提，无非是说形而上学与科学应当是相容的和连续的，这一点估计很少有人会反对。问题是，该论证的第二个前提到底在说什么？当代物理学所建立的世界图像真实可靠吗？其实，稍微熟悉科学史和科学哲学的人都知道，科学理论是可错的。既然如此，科学理论所推设的物项中，哪些可算作是形而上学的实体或关系？我们选择的标准又是什么？

对于这个问题，不同的物理主义者有不同的策略。策略之一是主张形而上学也是可错的，可以随科学理论的进展做出相应的修正，这实质上是否定形而上学的合法性。策略之二是对此置之不理，将选择权交给科学家和科学哲学家，这等于承认物理主义仅仅是心灵哲学中的一种形而上学主张。策略之三则是接受朴素的科学实在论(scientific realism)，认为科学中所推设的一切，都是世界中的真实存在，在符合真理论的意义上为真。最后一种策略，也是大多数物理主义者所采取的策略

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