1、主要是所颁发的证书不同。在职研究生是一个泛指的概念，包括多种研究生教育类型。其中有同等学力申硕、专业硕士学位教育等等。而与不在职的全日制研究生相比，因为缺少了系统的学习过程，所以通常不颁发学历证书（毕业证书），当符合要求以后只授予硕士学位。因此，在职研究生通常只颁发单证，在个人档案的学历一栏会写上“在职研究生学历”。全日制研究生则可以在毕业后同时获得双证，学历一栏会写“硕士研究生学历”； 2、就目前国内的社会认可度来说，目前确实是全日制的双证比在职研究生的单证更强一些。但是，由于现国际通行的学历制度中并没有“毕业证书”一项，就是以学位证书同时代双证使用，所以在国外使用的话两者并没有太大区别。由于我国现行的制度是跟随前苏联的双证制而来，因此对学位证书的专门认可已经逐渐成为一个趋势，国家的越来越多部门在涉及学历认定时都承认单证获得者等同于双证的待遇。当然将来国家的政策导向、如何改革还不确定。

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