超二级结构很好理解,就是结构比二级结构(α螺旋,β折叠,无规卷曲)复杂,但未达到三级结构复杂度的状态。
结构域(domain)是蛋白中具有特异空间结构和独立功能的区域,就是属于超二级结构的,介于二级和三级结构之间,这里着重理解结构域是蛋白质发挥生物学效用的关键功能单位,并且具有特定的空间构型。——以上可以解释超二级结构和结构域。
而模体(motif)则是蛋白质分子中具有特定空间构象和特定功能的结构成分,一个模体总有其特征性的氨基酸序列,并发挥特殊的功能。motif一般也是超二级结构。
而motif和domain的区别可以这样理解:motif是蛋白中较小的保守序列片断,比domain小,若干motif可形成一个domain,因此motif可以理解为domain的一个亚单位。
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