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EST序列ESTs和基因组序列注释

作者:职业培训 时间: 2025-01-14 03:48:45 阅读:658

EST序列,即Expressed Sequence Tags,是基因组研究中的重要工具,但并非完美无缺。ESTs由反转录mRNA生成,其精确度受限于剪切后的单列序列位点,通常只能达到97%的准确度。由于表达倾向(expression bias)的存在,低表达的基因在EST数据库中不易被发现,而高表达的基因则可能过度代表。为了构建理想的cDNA文库,必须采用前处理技术,如均等化(normalization)以减少富集于高表达基因的cDNA数量,以及消减杂交(subtractive hybridization)以去除文库中的冗余克隆,以减少多克隆效应。

华盛顿大学基因组测序中心和Sanger中心合作,通过EST技术,成功完成了秀丽线虫(C.elegans)10亿碱基对的基因组测序项目,这表明ESTs在基因组序列解析中起着关键作用。EST技术的应用不仅限于基因组DNA序列的获取,还能够精确预测基因的内含子和外显子排列,识别选择性接合事件,以及识别基因组的异常排列结构,这些都是基于基因组序列的基因研究中的重要应用。

扩展资料

表达序列标签(expressed sequence tags,ESTs)是指从不同组织来源的cDNA序列。这一概念首次由Adams 等于1991年提出。近年来由此形成的技术路线被广泛应用于基因识别、绘制基因表达图谱、寻找新基因等研究领域,并且取得了显著成效。在通过mRNA差异显示、代表性差异分析等方法获得未知基因的cDNA部分序列后,研究者都迫切希望克隆到其全长cDNA序列,以便对该基因的功能进行研究。

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文章来源:天狐定制

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