SSR标记是分析具有1-6个核苷酸重复序列的DNA区域的分子标记。其主要重要性在于遗传结构分析，显示共显性特征，识别杂合位点，鉴定多等位基因性质，同时具备高多态性和基因组均匀分布的特性。

SSR标记的核苷酸序列放大了串联核苷酸重复。微卫星是具有重复核苷酸序列的DNA基序，存在于基因组中数千次。SSR和STR是两种微卫星DNA类型，SSR通过扩增串联核苷酸来识别位点。

而ISSR标记是另一种显性DNA序列的DNA标记，其核苷酸序列长约100-300个。通过使用引物扩增，ISSR标记允许在单个实验中分析多个位点。它们出现在两个微卫星重复序列之间，允许扩增基因组中的随机DNA序列。

ISSR标记是显性DNA序列，只能检查DNA序列的存在与否，对鉴定品种的遗传变异很重要。它们是基因组DNA序列的一部分，具有较长的重复序列。

SSR和ISSR标记的主要区别在于重复的类型。SSR标记在微卫星中，而ISSR标记在微卫星DNA之间。SSR标记识别杂合位点，而ISSR标记分析随机DNA序列。两者都是对群体表征很重要的遗传标记，但使用场景和分析结果有所不同。

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文章来源：天狐定制

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