公司扣增值税通常使用专业的税务管理软件。

解释：

一、税务管理软件的功能

税务管理软件是企业进行财务管理、税务申报、税款计算的重要工具。这些软件能够帮助企业按照税法规定，自动完成增值税的计算、扣缴和其他相关税务处理工作。它们具有高度的数据准确性和处理效率，能够确保企业税务工作的合规性。

二、增值税扣缴的具体操作

在税务管理软件中，公司会输入相关的销售数据、采购数据、进项税等信息。软件会根据国家规定的税率，自动计算出应缴纳的增值税额。在确认数据无误后，软件会生成相应的税务报表，企业据此进行税款的缴纳。这样可以避免人为计算错误，提高税务处理的效率和准确性。

三、软件的选取

市场上存在多种税务管理软件，企业可以根据自身的需求和规模选择合适的软件。这些软件可能由专业的软件开发商开发，也可能包含在某些财务管理软件系统中。企业在选择时，应考虑软件的易用性、数据安全性、服务支持等方面，确保所选软件能够满足企业的实际需求。

四、数据安全性

使用税务管理软件处理增值税时，数据的安全性是非常重要的。企业应选择具有严格数据保护措施的软件，确保税务信息不被泄露。同时，企业还应建立相应的数据备份和恢复机制，以防数据丢失或损坏。

总的来说，公司扣增值税所使用的软件是税务管理软件，这类软件能够帮助企业高效、准确地完成增值税的计算和扣缴工作。企业在选择和使用这类软件时，应充分考虑软件的功能、操作便捷性、数据安全性等因素。

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文章来源：天狐定制

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